مدل‌سازی مولکولی برای مبتدیان

اختصاصی از فی دوو مدل‌سازی مولکولی برای مبتدیان دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

کتاب “مدل‌سازی مولکولی برای مبتدیان” یک معرفی مختصر و پایه‌ای از مدل‌سازی و شیمی محاسباتی است که بر ضروریات تمرکز می‌کند، شامل مدل‌سازی‌هایی مانند MM، MC، MD می‌باشد. همچنین شامل فصلی است که به مباحث QSAR و کشف شیمی اختصاص داده شده است.
این کتاب از رویکردی کاربردی استفاده می‌کند و شامل وب‌سایت‌های پشتیبان حاوی اطلاعات پیش‌زمینه، تصاویر کاملا رنگی، سوال و جواب‌‌هایی مرتبط با متن و بسیاری از مثال‌‌های همراه با راه‌حل می‌باشد.
کتاب “مدل‌سازی مولکولی برای مبتدیان” با ایجاد تغییراتی در اهمیت و عرضه سازگار با دانشجویان امروزی بازبینی شده است.

Molecular Modelling for Beginners

نویسنده: 

Alan Hinchliffe

انتشارات: 

Wiley

ISBN 10: 

0470513144

ISBN 13: 

9780470513149

تحقیق درباره ساخت غربال مولکولی کربنی توسط فرآیند دو مرحله ای انسداد روزنه های کربن فعال

اختصاصی از فی دوو تحقیق درباره ساخت غربال مولکولی کربنی توسط فرآیند دو مرحله ای انسداد روزنه های کربن فعال دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

فرمت فایل : word (قابل ویرایش) تعداد صفحات : 26 صفحه

چکیده

در مقاله حاضر، یک روش جدید تهیه غربال های مولکولی کربنی ارائه گردیده که در آن از فرآیند دو مرحله ای رسوب گذاری کربن و انسداد روزنه ها بر روی پایه ای از جنس کربن فعال تجاری استفاده شده است. در این روش و در نخستین مرحله انسداد روزنه ها، از تجزیه حرارتی هیدروکربن های موجود در قیر قطران زغال سنگ استفاده گردید و در مرحله دوم برای کاهش بیشتر ابعاد روزنه ها تا مقدار مناسب، از تجزیه حرارتی بخار بنزن استفاده شد. نتایج نشان داده اند که در مرحله تجزیه حرارتی هیدروکربن ها، یک ساختار متخلخل یکنواخت با ابعاد روزنه هایی حدود Å 5 در کربن بوجود می آید و در مرحله دوم، قطر روزنه ها در محصول به حدود Å 4 کاهش می یابد. این عمل، جداسازی سینتیکی اکسیژن از نیتروژن توسط ماده متخلخل بوجود آمده را امکان پذیر می سازد. همچنین در بررسی های به عمل آمده، اثر دما و زمان تجزیه حرارتی بخار بنزن نیز به منظور یافتن شرایط بهینه، مورد مطالعه قرار گرفته است.

مقدمه

غربال مولکولی کربنی[1] ماده ای است متخلخل با ساختمان آمورف که به شکل صفحات در هم پیچیده شده بوده و متوسط قطر روزنه ها در آن نزدیک به اندازه مولکول های جذب شونده می باشد [1].  جداسازی مولکول ها در غربال های مولکولی کربنی بر اساس اختلاف در سرعت نفوذ آنها به داخل روزنه های ریز[2] و یا به عبارت دیگر، سرعت جذب آنها می باشد. به کمک ویژگی فوق می توان از این مواد برای جداسازی مولکول هایی با ابعاد نزدیک به یکدیگر استفاده نمود.

     غربال های مولکولی کربنی به دلیل ماهیت شیمیایی و همچنین داشتن ساختار منحصر به فرد، در مقایسه با دیگر غربال های مولکولی نظیر زئولیت ها، مزایای قابل توجهی دارند که موجب می شوند تا بتوان از آنها در کاربردهای خاص و ویژه بهره جست. این مزایا عبارت از آبگریزی بالا، مقاومت شیمیایی در برابر اسیدها و بازها، پایداری ساختار کربنی در دمای بالا و در محیط های خنثی، دارا بودن روزنه های صفحه ای شکل (که امکان جداسازی مولکول های خطی از مولکول های شاخه دار را فراهم می سازند) و همچنین هزینه پایین ساخت می باشند.

     غربال های مولکولی کربنی در حال حاضر برای جداسازی مخلوط های گازی متعددی به کار برده شده اند که از جمله آنها می توان به جداسازی هوا (اکسیژن از نیتروژن)، متان از دی اکسید کربن، متان از گزنون، اتان از اتیلن، پروپان از پروپیلن و جداسازی هیدروژن از مخلوط گازها اشاره نمود [2, 3]. امروزه کاربرد غربال های مولکولی کربنی برای جداسازی هوا به خوبی توسعه داده شده و با استفاده از این جاذب ها در فرآیند جذب نوسانی با فشار(PSA[3])، می توان جریان نیتروژنی با خلوص 95  الی 7/99 درصد را از هوا تولید کرد.

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین و آب با استفاده از نرم افزار لمپس (LAMMPS)

اختصاصی از فی دوو (آشنایی با لمپس) - شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین و آب با استفاده از نرم افزار لمپس (LAMMPS) دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

(آموزش lammps) در این آموزش شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین و آب با میدان نیروی charmm27 توضیح داده شده است. هدف از این شبیه سازی تولید دیتافایل و فایل ورودی برای شبیه سازی است. گام به گام و به زبان ساده توضیح داده شده است. همه فایلهای مورد نیاز برای این شبیه سازی در اختیار شما قرار میگیرد. حجم فایل در حدود ۲۰۰ مگابایت و مجموع طول ۲ فیلم (هم شبیه سازی پروتئین و هم شبیه سازی آب) ۴۳ دقیقه است. سعی شده است فیلم با بهترین کیفیت تولید شود. این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است.

دانلود مقاله ISI نقشه مولکولی سازمان ژنوم هسته ای پهنک برگ اثرات متقابل در طول تمایز

اختصاصی از فی دوو دانلود مقاله ISI نقشه مولکولی سازمان ژنوم هسته ای پهنک برگ اثرات متقابل در طول تمایز دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

موضوع فارسی :نقشه مولکولی سازمان ژنوم هسته ای پهنک برگ اثرات متقابل در طول تمایز

موضوع انگلیسی :<!--StartFragment -->

Molecular Maps of the Reorganization of Genome-Nuclear Lamina Interactions during Differentiation

تعداد صفحه :11

فرمت فایل :PDF

سال انتشار :2010

زبان مقاله : انگلیسی

سازمان سه بعدی از کروموزوم در درون هسته و پویایی آن در طول تمایز تا حد زیادی ناشناخته هستند. به تجسم این روند در جزئیات مولکولی، ما نقشه با وضوح بالا از فعل و انفعالات لایه ژنوم هسته ای در طول تمایز پس از آن از سلولهای بنیادی جنینی موش از طریق سلول های پیش ساز عصبی-اصل و نسب متعهد به آستروسیتها علاج متفاوت تولید می شود. این نشان می دهد که در حال حاضر معماری کروموزوم پایه در سلول های بنیادی جنینی است در مجموع در صدها سایت در طول تعهد اصل و نسب و تمایز انتهایی پس از آن تغییر داده است. این بازسازی شامل هر دو واحد رونویسی و مناطق چند ژنی و ژن های بسیاری است که تعیین هویت های تلفن همراه تاثیر می گذارد. اغلب، ژن هایی که حرکت به دور از لایه هستند همزمان فعال. بسیاری دیگر، با این حال، غیر فعال باقی می ماند و در عین حال در یک گام تمایز بعدی قفل برای فعال سازی تبدیل شده است. این نتایج نشان می دهد که فعل و انفعالات لایه ژنوم به طور گسترده ای در کنترل برنامه های بیان ژن در طول تعهد اصل و نسب و تمایز انتهایی دخالت دارند.

دانلود مقاله ISIهمگرایی و تکرارپذیری در شبیه سازی دینامیک مولکولی از دوبلکس

اختصاصی از فی دوو دانلود مقاله ISIهمگرایی و تکرارپذیری در شبیه سازی دینامیک مولکولی از دوبلکس دانلود با لینک مستقیم و پر سرعت .

موضوع فارسی:همگرایی و تکرارپذیری در شبیه سازی دینامیک مولکولی از دوبلکس 

موضوع انگلیسی :<!--StartFragment -->

Convergence and reproducibility in molecular dynamics simulations of the DNA duplex d

تعداد صفحه :18

فرمت فایل :PDF

سال انتشار :2015

زبان مقاله : انگلیسی

سابقه و هدف: ساختار و دینامیک DNA انتقادی به عملکرد آن مربوط می شود. شبیه سازی دینامیک مولکولی تقویت آزمایش با ارائه اطلاعات دقیق در مورد حرکات اتمی است. با این حال، تا به امروز شبیه سازی به اندازه کافی طولانی برای همگرایی پویایی و خواص ساختاری DNA نبوده است. مواد و روش ها: شبیه سازی دینامیک مولکولی با کهربا با استفاده از ff99SB نیروی میدانی با parmbsc0 مودی کاتیونهای فی، از جمله گروه شبیه سازی مستقل انجام، به زمانبندی دینامیک مولکولی طولانی با تخصصی موتور آنتون MD در ساختار B-DNA د (GCACGAACGAACGAACGC) انجام شد. برای ارزیابی همگرایی، زوال ارزش RMSD طور متوسط ​​بیش از فواصل زمانی طولانی تر و طولانی علاوه بر ارزیابی همگرایی پویایی از طریق واگرایی کولبک-لیبلر اصل نمودار هیستوگرام جزء طرح بررسی شد.
نتایج: این شبیه سازی دینامیک مولکولی از جمله یکی از طولانی ترین شبیه سازی از DNA در به روز منتشر شده ~ 44 میکرو ثانیه، جای تعجب نشان می دهد که ساختار و دینامیک مارپیچ DNA را، غفلت از جفت ترمینال، اساسا به طور کامل در ~ 1- همگرا 5 میکرو ثانیه زمانبندی.
نتیجهگیری: ما هم اکنون می توانید reproducibly همگرا ساختار و پویایی مارپیچ B-DNA، حذف جفت ترمینال، در مقیاس میکرو ثانیه زمان با هر دو کهربا و CHARMM C36 اسید نوکلئیک زمینه نیروی Fi است. نمایش نتایج: از گروه مستقل از شبیه سازی با شروع از شرایط مختلف اولیه، هنگامی که جمع آوری شده، مطابقت با نتایج حاصل از شبیه سازی زمانبندی طولانی بر روی موتور تخصصی آنتون MD.
عمومی قابل cance فی: با دسترسی به منابع GPU در مقیاس بزرگ و یا موتور MD تخصصی «آنتون» آن را برای انواع سیستم های مولکولی به reproducibly و قابل اعتماد همگرا مجموعه ساختاری سازه نمونه امکان پذیر است. پیشرفت های اخیر در دینامیک مولکولی: این مقاله بخشی از یک موضوع خاص تحت عنوان است.
© 2014 نویسندگان. منتشر شده توسط الزویر B.V. این یک مقاله با دسترسی آزاد تحت CC BY-NC-SA مجوز
(http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/).